Retour sur la journée « Outils numériques pour accélérer les bioproductions »

L’axe de recherche dédié aux méthodologies et outils transversaux du PEPR Bioproductions, a organisé le 18 novembre à Paris une journée d’échanges autour des méthodes, modèles et plateformes qui transforment aujourd’hui les biotechnologies. Plusieurs projets ont ainsi présenté les outils qu’ils utilisent ou développent dans le cadre du programme, l’objectif étant de détecter ceux utilisables par d’autres projets.

Cet axe répond à deux défis majeurs :

  • Inventorier, normaliser et rendre accessibles les ressources expérimentales afin de faciliter l’échange de logiciels et données et réduire les coûts de développement.
  • Exploiter les données expérimentales grâce à l’apprentissage automatique pour construire des modèles prédictifs précis — un levier essentiel pour comprendre la réactivité et la transformation de la biomasse, et optimiser les procédés.

La journée a mis en lumière l’avancée de ces travaux, avec :

  • Le traitement et l’analyse de données spectrales
  •  Des potentiels basés sur l’apprentissage machine pour optimiser les simulations atomistiques pour le calcul des vitesses de réactions
  • Des modèles de prédiction pour la réactivité en hydrolyse enzymatique de la biomasse
  •  Des modèles mécanistique et des modèles hybrides apprentissage machine /mécanistiques
  •  Le développement d’outils de standardisation des protocoles expérimentaux pour la FAIRisation des données
  •  Des outils d’ingénierie de souches microbiennes pour la bioproduction
  •  De la rétro-ingénierie de la représentation moléculaire
  •  La modélisation de bioréacteurs

Un grand merci à tous les intervenant(e)s et participant(e)s pour la qualité des échanges et la dynamique collective !

Pour plus d’informations sur cet axe de recherche : cliquez ici.